1. Pura .zip johonkin kansioon
2. Tuplaklikkaa download-firmware.bat tiedostoa
3. Valitse COM-portti johon Megasquirt on kytketty
4. vastaa Yes jos Megasquirtissa on tällä hetkellä alkuperäinen koodi sisällä, muuten No.
5. Jos vastasit ym. kysymykseen No, hyppää suoraan kohtaan 9
6. Sammuta Megasquirt ja paina jotain näppäintä
7. Jumpperoi boot-jumpperi piirilevyltä ja paina jotain näppäintä
8. Kytke virta Megasquirtiin ja paina jotain näppäintä
9. Odota rauhassa kun uusi koodi menee sisään (vähän yli 1100 riviä)
10. Ruudulle tulee ilmoitus päivityksen onnistumisesta, käynnistä megasquirt uudelleen
11. Kopioi zipin mukana tullut msns-extra.ini c:\program files\megasquirt\car1\mtcfg kansioon ja editoi settings.ini tiedostoon halutut asetukset. Megatunen voi käynnistää ja alkaa ihmetellä uusia ominaisuuksia

HUOM!
Extra-koodin versiosta 022 eteenpäin karttojen sijainita muistiavaruudessa on muutettu. Jos päivität koodia versiosta 022 vanhemmasta, ei ole suositeltavaa ladata suoraan vanhaa setuppia. Varminta on tehdä asetukset uudelleen käsin ja siirtää kartat export/import toimintojen avulla.
Aina, kun päivität uuden extra-version ja lataat vanhan setupin megatuneen, kannattaa todellakin käydä joka ikinen valikko läpi ja tehdä sopivat asetukset uusiin ominaisuuksiin, ilman sitä Mega voi toimia väärin tai olla toimimatta kokonaan.